Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors

Kes demam denggi dilaporkan meningkat setiap tahun, namun sehingga kini belum ada ubat anti-denggi boleh didapati di pasaran. Oleh itu, pencarian ejen anti-denggi adalah kritikal. Pemotongan poliprotein pelopor oleh enzim protease NS2B-NS3 merupakan proses yang sangat penting untuk replikasi flavivi...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Mohd Nawi, Mohamed Sufian
Format: Thesis
Language:English
Published: 2015
Subjects:
Online Access:http://eprints.usm.my/31902/1/MOHAMED_SUFIAN_BIN_MOHD_NAWI.pdf
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id my-usm-ep.31902
record_format uketd_dc
spelling my-usm-ep.319022019-04-12T05:25:41Z Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors 2015-08 Mohd Nawi, Mohamed Sufian RS1-441 Pharmacy and materia medica Kes demam denggi dilaporkan meningkat setiap tahun, namun sehingga kini belum ada ubat anti-denggi boleh didapati di pasaran. Oleh itu, pencarian ejen anti-denggi adalah kritikal. Pemotongan poliprotein pelopor oleh enzim protease NS2B-NS3 merupakan proses yang sangat penting untuk replikasi flavivirus. Oleh itu enzim protease NS2B-NS3 sesuai dijadikan sasaran untuk membangunkan ubat anti-denggi. Di Malaysia, Denggi-2 adalah jenis sera yang paling lazim. Dalam kajian ini, pendekatan berasaskan ligan telah dilaksanakan dalam mencari perencat enzim protease NS2B-NS3 Denggi-2 baharu yang berpotensi. Model farmakofor telah dihasilkan daripada pelbagai struktur perencat enzim protease NS2B-NS3 Denggi-2 yang pernah dilaporkan, yang terdiri daripada molekul peptida dan bukan peptida. Model farmakofor terpilih telah digunakan untuk menyaring senarai sebatian dalam pengkalan data National Cancer Institute, AS (NCI) untuk mencari perencat protease NS2B-NS3 Denggi-2 yang baharu secara maya. The reported dengue cases are increasing yearly, yet no anti-dengue agent is available in the market. Therefore, the search for anti-dengue is critical. In Malaysia, Dengue-2 (DEN-2) is the most prevalent serotype. NS2B-NS3 protease is the enzyme for the cleavage of polyprotein precursor, which is crucial for the flavivirus replications. This makes it a potential target for the development of therapeutics against the dengue virus. In this study, ligand-based approach was implemented in searching for the new potential DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors. Pharmacophore models were developed from diverse reported structures of DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors, comprising peptide and non-peptide molecules. The selected pharmacophore models were employed to screen the US National Cancer Institute (NCI) list of compounds to search for new DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors. 2015-08 Thesis http://eprints.usm.my/31902/ http://eprints.usm.my/31902/1/MOHAMED_SUFIAN_BIN_MOHD_NAWI.pdf application/pdf en public phd doctoral Universiti Sains Malaysia Pusat Pengajian Sains Farmasi
institution Universiti Sains Malaysia
collection USM Institutional Repository
language English
topic RS1-441 Pharmacy and materia medica
spellingShingle RS1-441 Pharmacy and materia medica
Mohd Nawi, Mohamed Sufian
Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
description Kes demam denggi dilaporkan meningkat setiap tahun, namun sehingga kini belum ada ubat anti-denggi boleh didapati di pasaran. Oleh itu, pencarian ejen anti-denggi adalah kritikal. Pemotongan poliprotein pelopor oleh enzim protease NS2B-NS3 merupakan proses yang sangat penting untuk replikasi flavivirus. Oleh itu enzim protease NS2B-NS3 sesuai dijadikan sasaran untuk membangunkan ubat anti-denggi. Di Malaysia, Denggi-2 adalah jenis sera yang paling lazim. Dalam kajian ini, pendekatan berasaskan ligan telah dilaksanakan dalam mencari perencat enzim protease NS2B-NS3 Denggi-2 baharu yang berpotensi. Model farmakofor telah dihasilkan daripada pelbagai struktur perencat enzim protease NS2B-NS3 Denggi-2 yang pernah dilaporkan, yang terdiri daripada molekul peptida dan bukan peptida. Model farmakofor terpilih telah digunakan untuk menyaring senarai sebatian dalam pengkalan data National Cancer Institute, AS (NCI) untuk mencari perencat protease NS2B-NS3 Denggi-2 yang baharu secara maya. The reported dengue cases are increasing yearly, yet no anti-dengue agent is available in the market. Therefore, the search for anti-dengue is critical. In Malaysia, Dengue-2 (DEN-2) is the most prevalent serotype. NS2B-NS3 protease is the enzyme for the cleavage of polyprotein precursor, which is crucial for the flavivirus replications. This makes it a potential target for the development of therapeutics against the dengue virus. In this study, ligand-based approach was implemented in searching for the new potential DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors. Pharmacophore models were developed from diverse reported structures of DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors, comprising peptide and non-peptide molecules. The selected pharmacophore models were employed to screen the US National Cancer Institute (NCI) list of compounds to search for new DEN-2 NS2B-NS3 protease inhibitors.
format Thesis
qualification_name Doctor of Philosophy (PhD.)
qualification_level Doctorate
author Mohd Nawi, Mohamed Sufian
author_facet Mohd Nawi, Mohamed Sufian
author_sort Mohd Nawi, Mohamed Sufian
title Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
title_short Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
title_full Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
title_fullStr Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
title_full_unstemmed Ligand Based Drug Discovery Of Novel Dengue-2 NS2B-NS3 Protease Inhibitors
title_sort ligand based drug discovery of novel dengue-2 ns2b-ns3 protease inhibitors
granting_institution Universiti Sains Malaysia
granting_department Pusat Pengajian Sains Farmasi
publishDate 2015
url http://eprints.usm.my/31902/1/MOHAMED_SUFIAN_BIN_MOHD_NAWI.pdf
_version_ 1747820505614778368